Nouveaux gènes liés au diabète

« Les scientifiques ont trouvé six nouveaux gènes liés au diabète de type 2 », rapporte The Guardian aujourd’hui. Il poursuit en disant que la découverte permettra d’améliorer la compréhension de la façon dont la maladie se développe. Le Times couvre également l’histoire, en disant que l’étude a découvert un risque accru de diabète avec plusieurs variantes de gènes, dont l’un a déjà été associée à une réduction du risque de cancer de la prostate.

L’étude qui sous-tend ces rapports est une méta-analyse de trois études d’association pangénomique dont les résultats ont été reproduits dans d’autres populations. Il fournit de bonnes preuves qu’il existe d’autres variantes de gènes qui peuvent augmenter la susceptibilité d’une personne au diabète de type 2, une condition associée à l’âge croissant et à l’obésité qui se caractérise par la résistance du corps à l’insuline.

Plus de recherche est nécessaire avant que ces résultats peuvent être traduits en outils pour le diagnostic ou l’amélioration des traitements. Il faut comprendre que ces variantes génétiques augmentent la susceptibilité à la maladie, mais elles ne la provoquent pas. Il existe une foule d’autres facteurs, y compris environnementaux, à l’œuvre dans le développement du diabète de type 2.

D’où vient l’histoire?

Le Dr Eleftheria Zeggini et ses collègues du Consortium sur la réplication et la méta-analyse du diabète génétique (DIAGRAM) de l’Université du Michigan, de l’Université du Michigan, du Massachusetts General Hospital et de la Harvard Medical School ont réalisé cette méta-analyse. L’étude a été publiée dans Nature Genetics, une revue médicale évaluée par des pairs.

Quel genre d’étude scientifique était-ce?

Pour cette publication, les chercheurs ont effectué une méta-analyse de trois études d’association pangénomique antérieures qui ont étudié les liens entre certains variants de gènes et le diabète de type 2. Les trois études étaient l’Initiative sur la génétique du diabète (DGI), l’Enquête Finlande-États-Unis sur la génétique du NIDDM (FUSION) et le Consortium pour le contrôle des cas de Wellcome Trust (WTCCC). Sur la base de cette mise en commun, 10 128 personnes et plus de 2,2 millions de variantes de gènes étaient disponibles pour l’analyse.

Comme la méta-analyse avait pour but d’identifier des variantes de gènes précédemment inconnues associées au diabète de type 2, les chercheurs ont exclu les variants (et les variants proches de ces gènes) qui ont été précédemment associés à la maladie.

Les études d’association à l’échelle du génome ont un inconvénient en ce sens que, indépendamment, elles peuvent avoir une capacité limitée à détecter quelques petites associations entre variants et maladies. En combinant les trois études, les chercheurs ont abordé cette limitation et leur analyse a eu un plus grand «pouvoir» (c.-à-d. Plus susceptible de ramasser une assocation s’il y en avait une) pour identifier des variantes supplémentaires que les études individuelles.

Pour confirmer leurs résultats, les chercheurs ont étudié les liens significatifs identifiés dans leur première méta-analyse chez 20 000 personnes supplémentaires dont les données étaient disponibles dans les trois études originales. Les liens qui étaient statistiquement significatifs à ce stade ont ensuite été étudiés en utilisant les résultats regroupés de 10 autres études (plus de 57 000 personnes supplémentaires).

Quels ont été les résultats de l’étude?

En combinant les populations dans des études antérieures, les chercheurs ont identifié six variantes de gènes auparavant inconnues qui avaient une association significative avec le diabète de type 2. Les chercheurs disent que le séquençage et la cartographie supplémentaires sont nécessaires pour identifier exactement où ces variantes de gènes sont, bien qu’ils donnent une indication de quels gènes ils sont proches.

La preuve la plus forte pour une association était avec une variante dans une région non codante d’un gène appelé JAZF1. Les chercheurs disent qu’une autre variante de ce même gène a été associée au cancer de la prostate. Dans l’ensemble, les personnes qui avaient cette variante particulière étaient 1,1 fois (IC à 95% de 1,07 à 1,13) plus susceptibles d’avoir le diabète de type 2. Les cinq autres variantes étaient également significativement associées à une probabilité accrue de diabète de type 2.

Quelles interprétations les chercheurs ont-ils tirées de ces résultats?

Les chercheurs concluent qu’ils ont détecté au moins six locus « inconnus avec des preuves solides d’association » avec le diabète de type 2. En outre, ils disent que leurs résultats montrent qu’il est utile d’utiliser leur approche méta-analytique pour mieux comprendre la base héréditaire du diabète de type 2.

Que fait le NHS Knowledge Service de cette étude?

C’est une étude bien menée qui combine la recherche utilisant des méthodes reconnues dans ce domaine. En combinant les résultats d’autres études, les chercheurs ont augmenté la puissance des données existantes pour détecter des relations auparavant inconnues entre les variantes de gènes et le diabète de type 2. Les chercheurs ont pu montrer que les associations qu’ils estimaient importantes avaient un mode d’association similaire dans des populations distinctes.

Les aspects de cette étude à considérer comprennent:

Pour chacune des nouvelles variantes qu’ils identifient, les chercheurs discutent d’une raison biologique potentielle pour laquelle la variante pourrait avoir un effet sur la susceptibilité au diabète.

Comme pour toutes les méta-analyses, certains biais peuvent être introduits dans la sélection des études combinées. c’est pourquoi une approche systématique est la meilleure. Le document de recherche ne précise pas pourquoi les chercheurs ont choisi les trois études qui ont été utilisées.

L’article du Times se concentrait principalement sur le «compromis» entre le diabète de type 2 et le cancer de la prostate basé sur la présence d’un variant de gène, mais l’étude n’a pas étudié le cancer de la prostate. Il n’est pas possible de tirer des conclusions sur la relation entre l’un des variants du gène et le cancer de la prostate sur la base de cette étude.

Fait important, même si ces types d’études devaient identifier toutes les variantes génétiques possibles associées au diabète de type 2, elles ne signifient pas qu’une personne ayant une variante génique particulière développera la maladie. Il existe une foule d’autres facteurs liés au risque, notamment l’indice de masse corporelle (IMC), le cholestérol et la pression artérielle.

D’autres études sont nécessaires avant que ces résultats soient traduits en technologies qui pourraient aider au traitement ou au diagnostic de la maladie. Les chercheurs affirment également qu’une recherche plus approfondie et une cartographie sont nécessaires pour identifier exactement où sont situées les variantes.